Shopify מייצרת robots.txt ברירת מחדל שחוסמת אוטומטית נתיבים פנימיים כמו `/cart`, `/checkout`, `/admin` ודפי תיוג כפול — נתיבים שאין טעם שגוגל תאנדקס. בחנויות עם Online Store 2.0 ניתן לשנות את ההתנהגות דרך קובץ `robots.txt.liquid` שמאפשר להוסיף חסימות (`Disallow`) או לפתוח נתיבים שנחסמו בברירת המחדל.
בחנות ישראלית שכיח לטעות בשני כיוונים: לחסום תת-קולקציות בעלות תנועת SEO אמיתית, או לפתוח עמודי פילטר כמו `?sort_by=` שמייצרים כפילויות אינדוקס ומבזבזים crawl budget. לפני כל שינוי ב-`robots.txt.liquid` כדאי לבדוק ב-Google Search Console אילו נתיבים כבר סרוקים ומה ה-crawl budget הנוכחי של החנות.