כאשר חנות שופיפיי משתמשת ב-Shopify Payments, Shop Pay מופעל אוטומטית כאחד מאמצעי הקופה המהירה. הסוחר רק צריך לוודא שהכפתור מופיע בעמוד מוצר ובעגלה — בעורך התבנית. במקרים נדירים בתבניות ישנות הכפתור מוסתר וצריך להפעיל ידנית את בלוק 'Accelerated checkouts'.

אם החנות לא משתמשת ב-Shopify Payments (מעדיפה ספק סליקה ישראלי כמו פאי או היפר), Shop Pay לא זמין. לרוב זה ה-trade-off המרכזי בהחלטה בין סליקה מקומית לבין שופיפיי Payments בארץ.