בחנויות פיזיות שמשתמשות ב-Shopify POS המזומן אינו נספר באופן אוטומטי כמו עסקאות כרטיס. הסוחר נדרש לפתוח את הקופה בתחילת היום עם סכום פתיחה (Add cash ראשון), לדווח על מזומן נכנס מהזמנות, ולסגור עם ספירה בסוף היום (Cash management).

בישראל יש להוסיף לזה את חוק צמצום השימוש במזומן (תיקון 2018): עסקה במזומן מעל ₪6,000 בעסק או ₪15,000 בעסקה פרטית אסורה. כדאי לכלול בקופה הודעה אוטומטית למוכרים שמזכירה את הסף ולסרב לעסקה שעוברת אותו.