האפליקציה רצה על iPad או Android ומתחברת לחומרת קופה של Shopify (קורא כרטיסים, מגירת מזומנים, מדפסת קבלות). כל מכירה שנסגרת ב-POS מסתנכרנת אוטומטית עם החנות המקוונת — מלאי יורד, לקוח מתעדכן, הזמנה נרשמת. ניהול הרשאות הצוות נעשה דרך Staff בתוך ערוץ ה-POS, ואפשר להגדיר PIN לכל איש צוות בנפרד.
בישראל אפליקציית Shopify POS פחות נפוצה כי תמיכת חומרת הקופה הרשמית מוגבלת למדינות מסוימות, וחוקי קופה רושמת ישראליים (חוק קופות רושמות, דרישות מס הכנסה) דורשים פתרונות מוסמכים מקומית. סוחרים ישראליים עם חנות פיזית בדרך כלל משלבים Shopify עם מערכת קופה ישראלית דרך אינטגרציה, ולא משתמשים ב-POS app ישירות.