אפליקציות קופה עובדות דרך מנגנון ה-UI extensions של Shopify — הן מצהירות על בלוקים שמופיעים בתוך checkout editor (עורך הקופה), שם הסוחר יכול למקם, להסיר ולהגדיר אותם בדיוק כמו בלוקים רגילים בעורך התבנית. אפשר להוסיף כך שדה "הודעה למתנה", בחירת תאריך משלוח, הצגת חותמות אמון (trust badges), או קוד הפניה — כל אלה בלי לגעת בקוד ה-Liquid של הקופה עצמה.
לפני התקנת אפליקציית קופה בחנות ישראלית כדאי לבדוק שלושה דברים: שהאפליקציה תומכת ב-RTL וטקסט עברי בתוך הבלוקים שלה, שהיא לא מאטה את זמן טעינת הקופה (השפעה ישירה על המרה), ושהיא עומדת בדרישות ה-Built for Shopify — סימן שעברה בדיקת איכות רשמית. אם אפליקציה דורשת גישה ל-`write_orders` רק כדי להוסיף שדה טקסט — זה דגל אדום.