קוד HEX מייצג צבע כשלושה זוגות של ערכים הקסדצימליים (00–FF) שמתאימים לרמות האדום, הירוק והכחול (RGB) של הצבע. הפורמט הוא `#RRGGBB` — למשל `#000000` הוא שחור טהור ו-`#FFFFFF` לבן טהור. ב-Shopify אפשר להזין אותו ישירות בשדה טקסט לצד ה-Color picker, וזה מבטיח עקביות מדויקת בין כל רכיבי העיצוב של החנות.

בחנות עם ספר מותג (brand book) מומלץ לשמור רשימה מסודרת של קודי ה-HEX של כל צבעי המותג — ראשי, משני, רקע, טקסט, כפתורים — ולהשתמש בהם באופן עקבי בעורך התבנית, ב-Checkout Blocks וב-Branding editor. שינוי ב-Color picker בלי לתעד את הקוד עלול לגרום לסחיפת צבעים בין עדכונים, בייחוד כשמספר אנשים עובדים על אותה חנות שופיפיי.