Initial setup כולל: יצירת חשבון (Email + password), בחירת תוכנית (תקופת ניסיון של חודש), הגדרת Store name + currency + country, התקנת תבנית, הוספת מוצר ראשון. שופיפיי מציעה Setup wizard שמובילה צעד אחר צעד. הקמה ראשונית: 1-3 שעות.

בחנות ישראלית, Initial setup כולל גם: בחירת מטבע ILS, בחירת מדינה ישראל, פתיחת Shopify Payments (דורש KYC), והגדרת עברית כשפת חנות. אחרי השלמת ה-Initial setup, סוחר עובר ל-Catalog setup (הוספת מוצרים), Theme customization, וכו'.