ב-Shopify כל תפריט הוא ישות עצמאית שמכילה פריטי ניווט (links) שיכולים להצביע על קולקציה, מוצר, עמוד, בלוג, URL חיצוני, או תפריט מקונן (dropdown). התבנית קוראת לתפריט לפי ה-handle שלו דרך Liquid — `linklists.main-menu` למשל — ומציגה אותו בפוזיציה המתאימה. הגדרת התפריטים נעשית ב-Admin תחת Online Store → Navigation.
בחנות עברית RTL תפריטים הם בדרך כלל אחד מנקודות הכשל הראשונות: dropdowns שנפתחים לכיוון הלא נכון, אייקוני חץ הפוכים, ותפריטי המבורגר שמופיעים בצד שמאל במקום ימין. בנוסף, תפריטים לא מועתקים בשכפול חנות — הם נבנים מחדש ידנית, לכן כדאי לתעד את מבנה הניווט לפני כל מיגרציה.