מודעות בתשלום מאפשרות לחנות לייצר תנועה מיידית לעומת SEO שלוקח חודשים להניב תוצאות. הפלטפורמות הנפוצות לחנויות שופיפיי הן Google Shopping (מודעות מוצר בחיפוש), Meta Ads (פייסבוק ואינסטגרם), ו-TikTok Ads. Shopify מציעה אינטגרציות ישירות עם חלק מהפלטפורמות האלה, שמאפשרות סנכרון קטלוג, מעקב המרות ויצירת קהלי Custom Audience מתוך האדמין.
בשוק הישראלי, מודעות בתשלום דורשות תשומת לב למספר נקודות ייחודיות: טרגוט גאוגרפי לישראל לרוב משמעותית יקר יותר לקליק מאשר שווקים גדולים, קריאייטיב בעברית מניב CTR גבוה יותר מקריאייטיב מתורגם מאנגלית, ויש לוודא שפיקסל המעקב (Meta Pixel או Google Tag) מוגדר נכון דרך ה-Checkout של שופיפיי כדי שנתוני ההמרה יהיו מדויקים.