במצב Manual capture, סוחר יכול לסלוק חלק מההזמנה. דוגמה: הזמנה ₪500, חצי מוצרים נשלחים → Capture ₪250. החצי השני אחר כך → Capture ₪250 נוספים. שופיפיי תומך — בעמוד הזמנה, 'Capture partial amount'.
בחנות ישראלית עם Pre-orders ארוכים, Partial capture מאפשרת גמישות: סליקה כשהמוצר נשלח, לא בעת ההזמנה. מורכב לניהול — סוחר חייב לעקוב. רוב חנויות B2C מסתפקות ב-Single capture.