ב-Shopify Analytics אפשר לבנות דוחות מותאמים אישית: לבחור מדדים (מכירות, המרות, תנועה), להוסיף מסננים, לפלח לפי תאריך או מוצר, ולשמור את התצורה לשימוש חוזר. הדוחות האלה מאוחסנים בתוך החנות הספציפית ולא ניתן לייצא את ההגדרות שלהם כקובץ — הם קיימים רק בממשק של אותה חנות.
בעת שכפול חנות שופיפיי או מעבר לחנות חדשה, דוחות מותאמים אישית שמורים לא עוברים — יש לבנות אותם מחדש ידנית. לכן כדאי לתעד מראש אילו דוחות קריטיים קיימים (screenshot של ההגדרות), במיוחד דוחות עונתיים או דוחות לדיווח חשבונאי שמשתמשים בהם אחת לרבעון.