תעריפי משלוח מוגדרים בתוך Shipping profiles (פרופילי משלוח) ב-Shopify Admin. לכל פרופיל אפשר לקבוע כמה שיטות משלוח עם תעריפים שונים לאזורים גיאוגרפיים שונים — למשל משלוח חינם בישראל מעל 200 ש"ח, תעריף קבוע לחו"ל, ומשלוח אקספרס בתוספת מחיר. הלקוח רואה את השיטות הרלוונטיות לפי כתובתו בשלב ה-Checkout ובוחר ביניהן.
ב-Checkout Blocks ניתן להוסיף תוכן דינמי לצד כל Shipping rate ספציפי — למשל הסבר בעברית מתי צפוי להגיע החבילה, או אזהרה על עיכובים בשיטה מסוימת. זה נעשה דרך Display rules שמזהות את כותרת שיטת המשלוח ומציגות בלוק טקסט מותאם רק כשהלקוח בוחר בה — שימושי במיוחד לחנויות שמציעות גם איסוף עצמי וגם שליחות.