בניגוד להזמנה חד-פעמית, הזמנת מנוי יוצרת שרשרת של הזמנות עתידיות בקצב קבוע — שבועי, חודשי, דו-חודשי וכו׳. בכל מחזור Shopify מנסה לחייב את כרטיס האשראי המאוחסן, יוצרת הזמנה חדשה אם החיוב עבר, ומעבירה אותה לתהליך ה-fulfillment הרגיל. אפליקציות מנוי כמו Recharge או Shopify Subscriptions מנהלות את הלוגיקה הזו מעל Admin API ו-Billing API.
בחנות ישראלית שמוכרת מנויים חשוב לוודא שספק הסליקה תומך בחיובים חוזרים (recurring billing) — לא כל מסוף ישראלי מאפשר זאת. בנוסף, כתובת המשלוח ומחיר המשלוח עשויים להשתנות בין מחזורים, ולקוחות מצפים לקבל הודעה לפני כל חיוב. היעדר תקשורת יזומה הוא אחת הסיבות הנפוצות לביטולי מנוי וחיובים חוזרים.