Shopify מספקת TLS חינם לכל חנות (גם הדומיין המותאם). הפרוטוקול מאבטח את כל המידע שמועבר — סיסמאות, פרטי תשלום, כתובות. בלי TLS, הדפדפן יציג אזהרת 'Not secure' והלקוחות יברחו. גם רכש 1 = TLS חובה לכל חנות online.
בישראל זה רלוונטי לעמידה בתיקון 13 לחוק הגנת הפרטיות — דרושה אבטחה מספקת לנתוני לקוחות. Shopify TLS עומדת בדרישות. שווה לוודא שכל הדומיין על HTTPS (כולל subdomains) — שווה לבדוק עם ssllabs.com.