התוכנית הפעילה משפיעה כמעט על כל דבר בחנות: עמלת סליקה ב-Shopify Payments, מספר מיקומי מלאי, הרשאות לעבודה צוותית, גישה לדוחות מתקדמים, ויכולת להפעיל Shopify Markets. ניתן לראות את התוכנית תחת Settings → Plan ולשדרג או להוריד אותה בכל רגע.
בחנות ישראלית כדאי לבדוק את התוכנית כל רבעון: לעיתים החנות עברה את הסף שבו הוזלת עמלת סליקה ב-Advanced שווה יותר מההפרש בעלות החודשית. גם להפך — חנות שצמצמה פעילות עשויה להרוויח מהורדה מ-Advanced ל-Shopify ולחסוך עשרות דולרים בחודש.