גרסאות בטא של iOS ו-Android מכילות שינויים שטרם עברו בקרת איכות מלאה — ממשקי Bluetooth, USB, רשת, והרשאות אפליקציות עלולים להתנהג שונה מהגרסה היציבה. Shopify מגדירה סביבות לא נתמכות כ: מערכות בטא, מכשירים עם Jailbreak או Rooting, ומערכות הפעלה ישנות שיצאו מתמיכה. אפליקציית ה-Shopify POS לא מובטח שתרוץ כראוי בסביבות אלה, ותקלות שמדווחות מהן לא יקבלו תמיכה טכנית.
בחנות פיזית ישראלית שמפעילה POS — דוכן בשוק, חנות רהיטים, מספרה — גרסת בטא על טאבלט או אייפון של העובד עלולה להקפיא עסקה באמצע סליקה או לנתק את קורא הכרטיסים ברגע הכי לא נוח. כדאי להגדיר מדיניות ברורה: מכשירי POS נשארים על גרסה יציבה ומאושרת, ועדכוני מערכת הפעלה נבדקים קודם על מכשיר גיבוי.