Shopify מציעה קוראי כרטיסים קנייניים (כמו Shopify Card Reader ו-Shopify Terminal) שמתחברים לאפליקציית Shopify POS דרך Bluetooth או חיבור ישיר. הם תומכים בהחלקה, הכנסה ותשלום חסר-מגע (NFC), ומסנכרנים כל עסקה ישירות למערכת ההזמנות של החנות — כך שמלאי, דוחות מכירות ופרופיל הלקוח מתעדכנים בזמן אמת.
בישראל קוראי הכרטיסים הרשמיים של שופיפיי אינם זמינים עדיין דרך ערוצי הפצה מקומיים, ולכן סוחרים ישראליים שמוכרים פיזית נוהגים לחבר מסוף סליקה עצמאי (כמו של שב"א, CAL או תשלובת) ולרשום את העסקה ב-POS כ"תשלום חיצוני". חשוב להגדיר את סוג התשלום הזה כראוי בהגדרות ה-POS כדי שהדוחות יישארו מדויקים.