Shopify מצפה לפורמט CSV מוגדר מראש עם כותרות עמודה מדויקות כמו `Handle`, `Title`, `Variant SKU`, `Variant Price` ו-`Image Src`. הבעיות הנפוצות ביותר הן: עמודת `Handle` ריקה או כפולה (שגורמת לשורות מוצר להתנתק מהמאטר), ערך `Variant Price` שמכיל סימן מטבע או פסיק עשרוני במקום נקודה, תמונות עם URL שאינו ציבורי, ו-CSV שנשמר ב-encoding שגוי שגורם לתווי עברית להפוך לסימני שאלה.
בחנות עברית יש שתי מלכודות נוספות: ראשית, Excel מוציא לעתים קרובות CSV עם BOM (Byte Order Mark) שמבלבל את מנתח ה-CSV של Shopify ושובר את כותרת השורה הראשונה. שנית, שדה `Tags` שמכיל תגיות בעברית עם פסיקים בתוך ערך צריך להיות עטוף במרכאות כפולות — אחרת כל מילה תהפוך לתגית נפרדת. מומלץ תמיד לפתוח ולשמור את הקובץ ב-Google Sheets במקום ב-Excel לפני ייבוא.