מטא-שדות לקוח מרחיבים את מודל הלקוח של Shopify מעבר לשדות הקבועים (שם, אימייל, טלפון, כתובת). אפשר להגדיר בהם ערכים מסוגים שונים — טקסט, מספר, תאריך, JSON, boolean — ולקשור אליהם לוגיקה עסקית: הצגת תוכן מותאם בחזית, כללי הנחה ב-Checkout, או סגמנטציה בשיווק. הם נגישים דרך ה-Admin API, ה-Storefront API (עם טוקן של לקוח מחובר), ודרך Liquid בחנות Online Store.
שימוש נפוץ בחנויות ישראליות הוא עדכון מטא-שדה לקוח דרך Shopify Flow לאחר רכישה מסוימת — למשל לסמן לקוח כ"חבר מועדון" לאחר קנייה ראשונה, ואז להציג בלוק Checkout Blocks מותאם בקנייה הבאה. חשוב לוודא שהגדרות הפרטיות של החנות תואמות את חוק הגנת הפרטיות הישראלי כאשר מאחסנים נתונים אישיים נוספים מעבר למה שנדרש לביצוע העסקה.