בעורך Checkout Blocks ובעורך המיתוג של הקופה, Shopify מאפשרת לייצא את כל התצורה הפעילה — צבעים, פונטים, מיקומי בלוקים, הגדרות שדות — לקובץ JSON יחיד. את אותו קובץ אפשר לייבא מחדש (Import configuration) כדי לשחזר מצב קודם, להעביר הגדרות בין סביבת פיתוח לסביבת ייצור, או לשתף פרופיל מיתוג עם חנות אחת.
בחנות ישראלית שמנהלת מספר מותגים (multi-store) תחת אותו Shopify Partner account, ייצוא/ייבוא תצורה חוסך שעות עבודה: מגדירים את הקופה פעם אחת, מייצאים JSON, ומייבאים לחנויות הנוספות עם שינויים קלים בלבד. כדאי לשמור גרסאות ממוספרות של קובצי ה-JSON לפני כל שינוי גדול — זו נקודת החזרה הבטוחה ביותר כשאין גרסאות (version control) מובנות בממשק.