ב-Shopify, JavaScript נטענת משלוש מקורות עיקריים: קוד התבנית עצמה (קבצי `.js` בתיקיית `assets`), אפליקציות שמוסיפות סקריפטים דרך App Embeds או Script Tags, ורכיבי Checkout extensions. הבעיה הנפוצה היא שכל אפליקציה מוסיפה סקריפט משלה, והמשקל המצטבר מאט את זמן הטעינה — מה שפוגע ב-Core Web Vitals וב-SEO של החנות.
מנועי חיפוש כמו Google יודעים לרנדר JavaScript, אבל הסריקה מתעכבת — קוד שמסתיר תוכן עד לאחר טעינה (lazy load אגרסיבי, תוכן שנטען רק אחרי אינטראקציה) עלול לא להיסרק כלל. בחנות עברית כדאי לוודא שתיאורי מוצרים, כותרות קולקציות וטקסטי SEO קריטיים קיימים ב-HTML הסטטי ולא תלויים ב-JavaScript שרץ אחרי טעינת הדף.