בניגוד ל-Admin API שדורש סודות חזקים וגישה מלאה לחנות, Storefront API מקבל public access token שמיועד לרוץ בדפדפן או באפליקציית מובייל. הוא מוגבל בכוונה לפעולות שלקוח קצה יכול לעשות: לקרוא מוצרים פעילים, להוסיף לעגלה, ליצור Checkout. את הנתונים הוא מחזיר ב-GraphQL — בקשה אחת יכולה להחזיר בדיוק את השדות שצריך בלי overfetch.
בחנות ישראלית headless שבנויה על Storefront API חשוב לזכור שני דברים: השפה והמטבע נקבעים על ידי context שמועבר בכל בקשה (`@inContext(country: IL, language: HE)`), וה-Checkout עדיין רץ אצל Shopify — אי אפשר "להחליף" את הקופה ב-React מותאם, רק לעטוף אותה. זו גם הסיבה ש-PCI נשאר באחריות Shopify גם בארכיטקטורת headless.