בתהליך Split shipping (פיצול משלוח) שבו הזמנה אחת מכילה מספר חבילות ממחסנים או ספקים שונים, Shopify מציגה בקופה שתי אפשרויות עיקריות: Lowest price ו-Fastest. בחירת Lowest price אומרת ש-Shopify מחשבת את שילוב שיטות המשלוח שמביא לעלות כוללת מינימלית עבור כל המשלוחים יחד, גם אם המשמעות היא שזמני האספקה לחבילות השונות לא יהיו זהים.
בחנות ישראלית שעובדת עם מספר ספקי לוגיסטיקה (למשל משלוח מהיר לאזור המרכז ודואר ישראל לפריפריה), Lowest price הוא לרוב הבחירה שמורידה נטישת עגלה — לקוחות רגישים למחיר המשלוח יותר מאשר למהירות. עם זאת, כדאי לבדוק שהעלות המוצגת בקופה מחושבת נכון עם מסי קנייה ישראליים ולא מציגה מחיר לפני מע"מ.