Site structure טוב: היררכיה ברורה (Home → Categories → Sub-categories → Products), קישורים פנימיים בין עמודים רלוונטיים, ו-Breadcrumbs. גוגל מעריך מבנה לוגי. שופיפיי תומך ב-Navigation editor + Theme settings.

בחנות ישראלית, השקעת זמן בתכנון מבנה אתר ראשוני (5-10 שעות) חוסכת תיקונים אחר כך. מבנה לוגי = SEO טוב + לקוחות מוצאים מהר. שינוי מבנה אחרי שנה = אובדן SEO זמני (Redirects קריטיים).