ב-Shopify POS הנחת אחוז מוגדרת כחלק מ-Apply discount בתוך ה-Smart Grid. בניגוד להנחת Amount (סכום קבוע) שמוריד סכום שקלי ספציפי, הנחת Percentage מחושבת תמיד יחסית לסל הנוכחי — כך שאם הלקוח מוסיף פריטים אחרי הגדרת ההנחה, הסכום המופחת עולה בהתאם. ההנחה מוצגת בממשק ה-POS מתחת לסיכום הביניים, לצד המחיר הקמעונאי המקורי.
בחנות ישראלית עם POS חשוב לוודא שהנחות אחוז מוגדרות בצורה שמסתדרת עם מחירים כולל מע"מ — שופיפיי מחשב את ה-Percentage על המחיר ברוטו כפי שהוגדר במוצר. אם מחיר המוצר כולל מע"מ, ההנחה חלה על הסכום הכולל ולא על הבסיס לפני מס, וזה צריך להיות ברור לצוות המכירות בנקודת המכירה.