Shopify מספקת את התכונות האלה ברמת הפלטפורמה: SSL בחינם על הדומיין, PCI DSS Level 1 על תהליך הסליקה, סינון Bot-protection אוטומטי על דפי קופה, וכלים לסוחר לחזק עוד יותר — 2FA חובה, מגבלת IP על הכניסה ל-Admin, התראות על שינוי הגדרות רגישות.
בישראל מצטרף לזה הצורך לעמוד בתיקון 13 לחוק הגנת הפרטיות — חלק מהתכונות האלה (audit log, ניהול הרשאות) הן בדיוק מה שמאפשר לסוחר ישראלי להוכיח שהוא מנהל את הגישה לנתוני הלקוחות באופן מבוקר.