תחת Settings → Shipping and delivery ב-Shopify ניתן לבנות shipping profiles — פרופילים שמקצים מוצרים שונים לכללי משלוח שונים. לדוגמה: מוצרים קלים מקבלים תעריף אחיד, מוצרים כבדים תעריף דינמי לפי משקל, ומוצרים דיגיטליים ללא משלוח כלל. לכל פרופיל מגדירים אזורי יעד, ולכל אזור — את שיטות המשלוח ותעריפיהן, כולל אפשרות למשלוח חינם מעל סכום מסוים.
בחנות ישראלית מגדירים כאן את ספקי השליחויות המקומיים (פדקס ישראל, DHL, חברות קורייר כגון להב, יונט, UPS) ואת נקודות ה-Click & Collect אם יש. חשוב לשים לב שתעריפי המשלוח מוצגים ב-Checkout לפני מס — אם המחיר ללקוח כולל מע"מ, יש לוודא שההגדרה עקבית עם הגדרות ה-Taxes and duties כדי שהלקוח לא יראה תעריף מפתיע בסיום הרכישה.