כאשר לקוח משלם בתשלומים דרך Shop Pay Installments, החנות אינה מקבלת את הכסף בתשלומים — Shopify מעבירה לחנות את מלוא הסכום לפי לוח הזמנים הרגיל של Shopify Payments (יומי, שבועי או ידני, בהתאם לתצורה שנקבעה). גביית התשלומים מהלקוח היא באחריות Shopify, לא הסוחר. כדי לראות אילו עסקאות מקורן ב-Installments, יש לסנן את דוח ה-payouts לפי Payment method בממשק האדמין.
חשוב לדעת שעסקאות Installments שממתינות להעברה לא מופיעות בעמוד Transactions עד שהתשלום בפועל מתבצע — כך שהיתרה הנראית בזמן אמת עשויה לא לשקף הזמנות Installments פתוחות. בישראל Shop Pay Installments אינו זמין נכון לעכשיו, אך סוחרים שמוכרים לשוק האמריקאי דרך חנות שופיפיי עשויים להיתקל בעסקאות מסוג זה בדוחות ה-payout שלהם.