Shopify Bundles מאפשרת לסוחר ליצור שני סוגי חבילות: חבילה קבועה (Fixed bundle) שבה הרכיבים נקבעים מראש, ומכפלה (Multipack) שבה הלקוח בוחר כמות מאותו מוצר. כשנמכרת חבילה, המלאי מנוכה אוטומטית מכל רכיב בנפרד — המשמעות היא שאין צורך לנהל SKU נפרד לחבילה, והמלאי נשאר מסונכרן עם יתר הערוצים בחנות.
בחנות ישראלית שמוכרת מארזי מתנה, קיטים עונתיים או חבילות "קנה 3 שלם 2", Shopify Bundles היא נקודת התחלה נוחה — אבל היא מוגבלת: אין תמיכה בחבילות דינמיות שבהן הלקוח בוחר את הרכיבים בעצמו. לסוחרים שצריכים גמישות כזו קיימות אפליקציות צד שלישי כמו Bundles.app או Rebundle, שתומכות גם בחבילות מותאמות-לקוח (configurator bundles).