כל עסקה שמתבצעת דרך Shopify Payments נאספת תחילה אצל שופיפיי, ולאחר תקופת המתנה (לרוב 1–3 ימי עסקים, תלוי בארץ ובסוג העסק) מועברת לחשבון הבנק של הסוחר כ-payout מאוחד. בדשבורד מגיעים אליהם דרך Settings → Payments → Shopify Payments → View payouts. כל payout מפרט את העסקאות שנכללו בו, עמלות, החזרים וזיכויים שקוזזו.
עסקאות שעדיין לא הגיעו לתאריך ה-payout שלהן לא יופיעו ברשימת ה-transactions הרגילה עד שהן נכנסות להעברה — לכן אם מחפשים עסקה ספציפית (למשל תשלום מ-Shop Pay Installments) ולא מוצאים אותה, כדאי לסנן לפי Payment method ולבדוק שהתאריך כבר עבר את חלון ה-payout. שופיפיי Payments אינו זמין כרגע ישירות בישראל, ולכן סוחרים ישראלים לרוב עובדים עם ספק סליקה חיצוני ולא רואים ממשק זה.