סוחרים יכולים לפתוח כמה חנויות (מותגים) באותו workspace רק עם Shopify Plus (multi-store). בתוכניות רגילות — כל חנות היא subscription נפרד. ניתן להקצות staff users שונים לכל חנות, או להעביר staff בין חנויות.

בישראל מי שמפעיל כמה חנויות (לדוגמה: חנות עברית + חנות אנגלית) צריך לשקול אם Plus משתלם. החלופה: market של Shopify (אותה חנות, שפות שונות), שפחות יקר אבל גם פחות גמיש.