כל תוכנית Shopify מאפשרת מספר מסוים של staff accounts: Basic 2, Shopify 5, Advanced 15, Plus ללא הגבלה. ההרשאות מוגדרות לפי אזורים: Products, Orders, Customers, Apps, Settings, Reports, ועוד. ניתן ליצור role-based templates ולשייך עובדים.

בישראל חשוב לאסור שיתוף חשבון בעלים — כל עובד עם חשבון משלו. גם להפעיל 2FA חובה (Settings → Plan → Security). מבחינה משפטית (תיקון 13) חובה לתעד מי ניגש לדאטה רגישה — שיתוף חשבון הופך את זה לבלתי אפשרי.