חשבון Shopify Admin הוא שער לכל נתוני החנות — הזמנות, פרטי לקוחות, חשבון תשלומים ומפתחות API. סיסמה חלשה או כזו שחוזרת על עצמה מחשבונות אחרים היא וקטור התקפה מרכזי: אם דלף ממסד נתונים אחר, תוקף יכול לנסות אותה גם על ה-Admin. סיסמה חזקה מכילה לפחות 12 תווים, שילוב של אותיות גדולות וקטנות, ספרות וסמלים, וחשוב מכך — לא ניתן לנחש אותה ממידע אישי ציבורי.
הדרך המעשית לנהל סיסמאות חזקות וייחודיות לכל שירות — כולל Shopify, ספקי אפליקציות, חשבון הדומיין וחשבון האימייל העסקי — היא שימוש ב-password manager (מנהל סיסמאות) כמו 1Password, Bitwarden או Dashlane. בנוסף, על כל חשבון Shopify לאפשר Two-step authentication (אימות דו-שלבי), כי גם סיסמה חזקה לבד אינה מספיקה אם הסוחר קורבן ל-phishing.