תגיות הן המנגנון הגמיש ביותר לסיווג נתונים בשופיפיי — אין צורך להגדיר אותן מראש, פשוט כותבים ערך ומוסיפים. למוצר אפשר להוסיף עשרות תגיות (למשל `קיץ`, `מבצע`, `XL`, `כשר-לפסח`), ואז ליצור קולקציה אוטומטית שמסננת לפי תגית, להריץ Rule בתוך Flow, או לסנן הזמנות ולקוחות לפי תגית ב-Admin. בתוך Liquid ניתן לגשת לתגיות דרך `product.tags`.
בייבוא CSV לחנות ישראלית חדשה — למשל בשכפול חנות — התגיות עוברות כ-string מופרד בפסיקים בעמודה `Tags`. חשוב לנקות תגיות ישנות שרלוונטיות רק להקשר מקורי (כמו שמות מחסנים ספציפיים או קמפיינים שנסגרו), ולוודא שהקולקציות האוטומטיות שמבוססות על תגיות בחנות החדשה מוגדרות לפני הייבוא, כדי שהמוצרים ייכנסו אוטומטית לקולקציה הנכונה.