הסרת ערוץ POS מהאדמין של Shopify היא לא רק מחיקת אפליקציה — היא פעולה שמשפיעה על מלאי, הזמנות פתוחות, והחזרים שטרם טופלו. לפני הביצוע יש להשלים את כל ה-POS orders הפתוחות, לטפל ב-Returns or refunds תלויים, ולוודא שמנוי POS Pro בוטל בנפרד — אחרת החיוב החודשי ימשיך גם אחרי שהאפליקציה הוסרה.
בחנויות ישראליות שמשלבות מכירה פיזית ואונליין חשוב לבדוק לפני ההסרה שמוצרי המלאי שהיו מוקצים לנקודת המכירה חוזרים לערוץ האונליין — Shopify לא תמיד מסנכרנת את זה אוטומטית. כמו כן, רשומות לקוחות שנאספו דרך POS נשארות ב-Admin אך חיבורן לפרופיל האונליין דורש בדיקה ידנית.