שותפי Shopify עובדים דרך Shopify Partners Dashboard — ממשק נפרד מה-Admin של הסוחר — שממנו הם יוצרים Development Stores, מנהלים מספר חנויות-לקוח במקביל, ומקבלים הכנסה משותפת (Revenue Share) על אפליקציות או תבניות שפיתחו. כשסוחר מזמין שותף לחנות שלו, השותף מקבל Staff Account עם הרשאות מוגדרות — ורצוי לצמצם אותן למה שנחוץ בלבד (למשל: גישה לתבנית ולמוצרים, בלי גישה לנתוני תשלום או לקוחות).
בשוק הישראלי חשוב לבדוק שהשותף מכיר את הספציפיות המקומית: תמיכה מלאה ב-RTL, הגדרת ש״ח כמטבע ראשי, חיבור לספקי סליקה ישראלים, ותמיכה בהנפקת חשבוניות מס תקינות. שותפים שנמצאים ב-Shopify Experts Marketplace סומנו על ידי Shopify, אך תמיד כדאי לבקש תיק עבודות עם דוגמאות של חנויות עברית שפעילות.