Shopify מציע שני סוגי חשבונות לקוח: Classic accounts (חשבונות עם סיסמה) ו-New customer accounts (חשבונות עם קוד חד-פעמי לאימייל, ללא סיסמה). השני הוא ברירת המחדל בחנויות חדשות וקלה יותר ללקוח כי הוא לא צריך לזכור סיסמה.

בחנות עברית כדאי לוודא שהממשק של החשבון תורגם לעברית מלאה — Shopify מספק תרגום אוטומטי לרוב המסכים אבל לא תמיד מושלם. בדיקת חוויית המשתמש של הלקוח מ-Order confirmation עד הגישה לחשבון היא חובה לפני השקה.