Shopify REST API מוגבל ל-2 קריאות לשנייה לחנות (4 ב-Advanced, 8 ב-Plus). GraphQL Admin API משתמש במודל 'cost' — כל שאילתה צורכת נקודות מתוך bucket. חריגה גורמת לתגובת `429 Too Many Requests` — האפליקציה צריכה לחכות ולנסות שוב.
בחנות עם אפליקציות רבות התקלה המקבילה: אפליקציה שהורתה לרשת עדכון מלאי על 1,000 וריאציות, פגעה במגבלה ונכשלה חצי דרך. ההמלצה: לאפליקציות מסונכרנות לבדוק שיש להן backoff וחלוקת קריאות לאצוות. אם אפליקציה ספציפית גורמת לבעיות חוזרות, שווה ליצור פנייה לפיתוח שלה.