ב-Shopify POS סורק ברקוד יכול להתחבר בשלוש דרכים: USB (דרך Shopify POS Hub או POS Tablet Stand עם USB-C), Bluetooth, או כסורק מובנה במצלמת המכשיר. בסריקה מוצלחת המוצר מאותר לפי ה-SKU או ה-barcode המוגדר בקטלוג החנות ומתווסף לסל הקנייה של הלקוח. הסורק גם שימושי לספירת מלאי מהירה ולביצוע החזרות לפי ברקוד של קבלה.
בחנויות פיזיות בישראל שמשתמשות בטאבלט אנדרואיד עם Shopify POS, חשוב לוודא שהסורק מופיע ברשימת החומרה הנתמכת של Shopify לפני הרכישה — לא כל סורק USB או Bluetooth עובד מהקופסה. סורקים שמחוברים דרך Shopify POS Hub מקבלים גם חשמל מהHub ולא צורכים סוללה נפרדת, מה שמתאים לנקודת מכירה קבועה.