ב-Shopify ניתן לבנות חבילות בכמה דרכים: דרך האפליקציה הרשמית Shopify Bundles (מבוססת על Component products), דרך אפליקציות צד שלישי (Bold Bundles, Bundler ועוד), או ידנית באמצעות מוצרים עם וריאציות מותאמות. ההבדל ביניהן קריטי — אפליקציית Shopify Bundles מנכה מלאי מכל מוצר-רכיב בנפרד, ואפליקציות צד שלישי עשויות לנהל מלאי באופן שונה לגמרי.
בחנות ישראלית שמוכרת חבילות חשוב לבדוק שני דברים לפני השקה: ראשית, שהחבילה מתנהגת נכון ב-Checkout כשמחיל קוד הנחה נוסף — יש מקרים שבהם הנחות לא מצטברות כצפוי. שנית, אם החבילה כוללת מוצר מנוי (Selling plan), שופיפיי מגבילה חלק מהתנהגויות הקופה כמו הוספת טיפ, מה שעלול להפתיע אם בניתם תהליך קופה מותאם.