ב-Shopify Plus ניתן ליצור מספר תצורות קופה מקבילות — תצורה פעילה שרואים הלקוחות, ותצורות טיוטה שאפשר לערוך ולבדוק לפני שמעלים לאוויר. את ניהול התצורות עושים דרך Checkout Blocks Branding editor, שמאפשר לשנות את העיצוב הוויזואלי של הקופה — כולל צבעי רקע, גופנים, גבולות שדות קלט ולוגו — בלי לגעת בקוד.
בחנויות ישראליות חשוב לוודא שתצורת הקופה הפעילה כוללת RTL מלא, תצוגת מחיר בש"ח, ושמות שדות בעברית ("מיקוד" במקום "ZIP code"). בעת מעבר בין תצורות, כדאי לבצע הזמנת בדיקה מלאה — כולל קוד הנחה ובחירת שיטת משלוח — כדי לוודא שהתצורה החדשה לא שוברת תרחישי קופה קריטיים.