בכל רגע נתון, ב-Settings → Billing של שופיפיי ניתן לראות את תאריך תחילת המחזור הנוכחי, תאריך החיוב הבא, והצטברות העלויות עד כה. המחזור כולל עלות מנוי קבועה (Basic, Grow, Advanced, Plus) ועלויות משתנות שמצטברות לאורך החודש: עמלות עסקאות על הזמנות, תשלומים לאפליקציות עם תמחור usage-based, ושימוש ב-Shopify Shipping.
בחנויות ישראליות שמשלמות ב-USD, כדאי לשים לב שהחיוב מתבצע בדולר מול כרטיס האשראי — ועמלת המרה של הבנק/חברת האשראי נוספת מעל. בעת שדרוג תוכנית באמצע מחזור, Shopify מחשבת פרורציה אוטומטית ומזכה את יתרת הימים שנותרו, כך שהחיוב בסוף המחזור יכלול רק את ההפרש.