פרופיל הלקוח ב-Shopify הוא ישות יחידה שמשותפת בין כל ערוצי המכירה: חנות האונליין, Shopify POS, ומכירות ידניות דרך Draft orders. כל הזמנה שהלקוח ביצע — בין אם מהספה ובין אם בחנות הפיזית — מצטרפת לאותה היסטוריה אחת. ניתן להוסיף לפרופיל תגיות (כגון "VIP", "סיטונאי"), הערות פנימיות לצוות, וכתובות שמרות שממלאות את ה-Checkout אוטומטית.
בחנויות ישראליות שמשלבות מכירה פיזית (POS) עם אונליין, פרופיל הלקוח הוא נקודת הציר: קופאי יכול לחפש לקוח לפי שם, טלפון או מייל ולצרף את ההזמנה הפיזית לפרופיל הקיים. כך נשמרת תמונה שלמה לצרכי שיווק חוזר, ניהול אחריות ותמיכת לקוחות — בלי לנהל שתי מערכות נפרדות.