Shopify מוציאה לפעמים דגמי קוראי כרטיסים מהשוק כאשר הם אינם עומדים בתקני PCI עדכניים, כשהטכנולוגיה שלהם מיושנת, או כשנשק חדש (כמו Tap & Chip Reader או WisePad 3) מחליף אותם. מכשירים מופסקים כמו ה-Swipe (מגנטי בלבד) וה-Chipper 1x לא יקבלו עדכוני firmware ועלולים להפסיק לתפקד לאחר עדכון של אפליקציית Shopify POS.
בישראל Shopify Payments אינו זמין נכון לעכשיו, ולכן קוראי הכרטיסים הרשמיים של שופיפיי POS אינם רלוונטיים לרוב הסוחרים המקומיים — הם מוגבלים לשווקים שבהם Shopify Payments פעיל. סוחרים ישראליים המפעילים נקודת מכירה פיזית נדרשים להשתמש בפתרונות סליקה מקומיים (כמו PayPlus, Cardcom) עם חיבור ידני לחנות, ולא בחומרת POS הרשמית של Shopify.