DNS (Domain Name System) הוא מערכת ה"ספר הטלפונים" של האינטרנט — היא ממירה שם דומיין קריא (mystore.co.il) לכתובת IP. ב-Shopify מנהלים את הגדרות ה-DNS מתוך Settings → Domains, ושם מוגדרות רשומות מסוג CNAME (שמצביעה אל `shops.shopify.com`), רשומות A לכתובות IP, ורשומות TXT לאימות בעלות על הדומיין. כל שינוי ב-DNS עשוי לקחת עד 48 שעות להתפשט ברחבי האינטרנט.
בחנויות ישראליות שרשומות אצל ספקים מקומיים (GoDaddy IL, Namecheap, טריו, קונסול) הגדרת ה-CNAME היא הצעד הראשון אחרי רכישת דומיין. כשרוצים לחנות דומיין (parking) מבלי לנתב אליו תנועה, מסירים את רשומת ה-CNAME שמצביעה ל-Shopify אבל שומרים את הדומיין מחובר לחשבון — כך מונעים שאחרים ירשמו אותו בינתיים.