שופיפיי מציעה Export types שונים לפי הקשר: Products → CSV (לעבודה ב-Excel), Orders → CSV (גם לעבודה ב-Excel) או PDF (לחשבוניות), Customers → CSV. רוב הייצואים ל-CSV — הפורמט הסטנדרטי שמאפשר עיבוד נוסף.

בחנות ישראלית, ההמלצה: ייצוא ל-CSV עם הגדרת UTF-8 בעת הורדה ב-Excel (כדי שעברית לא תישבר). אם יש צורך ב-PDF (לחשבוניות), שופיפיי מספק. אחסון הקבצים המיוצאים בענן (Drive, Dropbox) למקרה צורך.