הגדרת ה-fulfillment ב-Shopify היא לא פעולה אחת אלא שרשרת החלטות: מגדירים Locations (מיקומים) שמייצגים מחסנים, חנויות פיזיות או 3PL חיצוני; מחברים לכל מיקום Shipping profiles (פרופילי משלוח) עם תעריפים לפי אזור; מגדירים חבילות ב-Shopify Shipping; ומחליטים אם הטיפול בהזמנה יהיה ידני, אוטומטי, או דרך אפליקציית fulfillment חיצונית.
בחנות ישראלית שלב זה כולל בדרך כלל חיבור לחברת שליחויות מקומית (יונידיליבר, פקסל, דואר ישראל) דרך אפליקציה ייעודית, הגדרת איסוף עצמי כ-Location נפרד, ותיאום בין ה-fulfillment לבין מערכת הנהלת החשבונות לצורך הפקת חשבוניות בהתאם לחוקי מס קנייה ישראלים. גוצ׳ה נפוצה: אם location לא מחובר לפרופיל משלוח, מוצרים שמשויכים אליו לא יוצגו ב-Checkout.