ב-Shopify האוטומציה השיווקית מתחלקת לשני שכבות עיקריות: הפונקציונליות המובנית (Shopify Email, הודעות SMS, אוטומציית קופה נטושה דרך ה-Admin) ואפליקציות צד שלישי כמו Klaviyo, Omnisend או ActiveCampaign שמתחברות דרך ה-API. כל אוטומציה בנויה על טריגר (אירוע שמפעיל אותה), תנאי (פילטר על קהל היעד) ופעולה (שליחת הודעה, הוספה לסגמנט, עדכון תג לקוח).
בחנות ישראלית כדאי לשים לב לכמה נקודות: חוק הספאם הישראלי מחייב אפשרות הסרה ברורה בכל הודעה שיווקית, ולכן כל אוטומציה חייבת לכלול unsubscribe link. בנוסף, SMS בעברית צורך יותר תווים לפי תקן UTF-16 — הודעה שנראית קצרה בעברית עלולה להיספר כשתי הודעות לצורך חיוב. כדאי לבדוק את הספירה לפני שמפעילים קמפיין גדול.