כל דומיין חייב להצביע לשניים לפחות שרתי שמות שאומרים לרשת האינטרנט: "כל שאלה על הדומיין הזה — בואו אלינו". כשרוכשים דומיין ישירות דרך Shopify, שרתי השמות מוגדרים אוטומטית לשרתים של Shopify. כשמביאים דומיין חיצוני (למשל מ-GoDaddy, Wix, או רשם ישראלי כמו .co.il), צריך לשנות ידנית את שרתי השמות אצל הרשם לכתובות שסופקו על ידי שופיפיי — ואז ניהול כל רשומות ה-DNS עובר לאדמין של Shopify.
חשוב להבין שהחלפת שרתי שמות שונה מהצבעת CNAME בלבד: החלפה מלאה מעבירה שליטה על כל רשומות הדומיין (MX לאימייל, TXT לאימות, A לשרתים נוספים). בחנויות ישראליות שמשתמשות בכתובת אימייל עסקית על הדומיין (למשל Google Workspace), צריך לוודא שרשומות ה-MX מועתקות נכון לפני המעבר, אחרת האימייל עלול להפסיק לעבוד לאורך חלון ה-TTL.