כשנפתחת חנות חדשה ב-Shopify, המערכת מקצה כתובת ייחודית בפורמט `yourstore.myshopify.com`. זוהי הזהות הטכנית של החנות: היא משמשת לכניסה ל-Admin, לאימות ב-OAuth, לחיבור אפליקציות, ולתקשורת בין מערכות. גם אם הסוחר מגדיר דומיין מותאם כמו `www.my-shop.co.il` ולקוחות רואים רק אותו — ה-.myshopify.com עובדת ברקע בכל הזמן.
בפועל חשוב לשמור על הכתובת הזו בידיים: Shopify עשויה לבקש אותה בעת כניסה לאדמין, בפנייה לתמיכה, או בהגדרת אפליקציות. שם החנות ב-.myshopify.com לא ניתן לשינוי לאחר ההרשמה — אם בחרתם שם זמני בעת פתיחת החנות, הוא נשאר לעד כזהות הטכנית גם אחרי שינוי שם העסק.